たまにいますね。病院嫌い。
診察が出来ないくらいに怖がる犬は、見ました。
この問題行動の理由としては、人と犬の間に信頼関係がないからでしたね。

犬に信頼されていれば、どこ行こうが、なにをされようが、
犬は落ち着いているものです。
とは言え、特定の病院でとても怖い経験をした犬は、
心にトラウマを抱えてしまい、その病院をとても嫌う事も有ります。
一度怖いと感じたモノや、場所に馴らすのはとても大変なので、
思い切って病院を変えてみるのも良いかもしれません。