良くある問題行動ですね。
今まで見てきた中で、一番多いのが「マーキング」です。
対処方法は簡単で、治すのも難しくないのですが、大変(面倒くさい)です。
「マーキング」の場合、家の中でのルールを作りましょう。そして、必ず「1日2回」以上の散歩をしましょう。

本来、犬という生き物は、「きれい好き」です。なので、自分の巣穴である家は汚したくないのです。しかし、犬が主導権を握っていると、犬は、自分の立場を主張するために、家のいたるところでマーキングをします。

止めさせるには、犬から主導権を取り返しましょう。
「人が、犬の良きリーダー」であれば、マーキング行為はピタリと止まるでしょう。
そして、犬にストレスを溜めさせないように、毎日必ず散歩をしましょう。